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Cell|張澤民團(tuán)隊(duì)通過泛癌種單細(xì)胞整合分析揭示表型各異的腫瘤浸潤B細(xì)胞亞類

2024-07-25 13:47:59來源:BioArt瀏覽量:146



近些年來,腫瘤免疫治療的成功激發(fā)了對腫瘤微環(huán)境,特別是腫瘤免疫微環(huán)境全面深入的探究。此前,北京大學(xué)生物醫(yī)學(xué)前沿創(chuàng)新中心張澤民課題組的研究系統(tǒng)刻畫了腫瘤浸潤髓系細(xì)胞、T細(xì)胞和NK細(xì)胞的泛癌種單細(xì)胞圖譜,為腫瘤治療策略的研發(fā)提供了新的思路。然而,盡管B細(xì)胞在免疫中發(fā)揮著重要作用,它們受到的關(guān)注相對較少。

2024年7月23日,張澤民課題組在Cell發(fā)表了題為Pan-cancer single-cell dissection reveals phenotypically distinct B cell subtype的研究論文。該研究整合了來自19種癌癥類型患者的大規(guī)模單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù),描繪了腫瘤浸潤B細(xì)胞在泛癌種水平上豐度和構(gòu)成的異質(zhì)性,發(fā)現(xiàn)了能夠與CD4 T細(xì)胞進(jìn)行互作并具有預(yù)后潛力的腫瘤相關(guān)非典型B細(xì)胞(tumor-associated atypical B cell, TAAB


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本研究通過整合來自19種主要癌癥類型的649名患者的單細(xì)胞RNA測序數(shù)據(jù),構(gòu)建了包含511,857個B細(xì)胞的泛癌種B細(xì)胞單細(xì)胞表達(dá)譜圖譜,鑒定出5個B細(xì)胞大類和20個B細(xì)胞亞類。研究人員還利用算法重建了部分細(xì)胞的BCR序列,并對80例患者樣本進(jìn)行了腫瘤浸潤B細(xì)胞相關(guān)的免疫組化或多色免疫組化染色。

基于整合的數(shù)據(jù)資源,研究人員發(fā)現(xiàn)腫瘤浸潤B細(xì)胞的豐度和亞群組成在不同癌癥類型間表現(xiàn)出了明顯的偏好性。研究人員還觀察到在腫瘤中存在B細(xì)胞分化階段中重要的過渡亞群,例如,腫瘤中的生發(fā)中心B細(xì)胞前體(pre-germinal center B cell)和漿母細(xì)胞(plasmablast)。通過BCR序列分析,研究人員在腫瘤內(nèi)觀察到BCR序列演化的進(jìn)程,以及伴隨此演化過程中出現(xiàn)的從生發(fā)中心B細(xì)胞(germinal center B cell)向記憶B細(xì)胞(memory B cell)和抗體分泌細(xì)胞(antibody-secreting cell)的轉(zhuǎn)化,這與二級淋巴器官生發(fā)中心反應(yīng)的過程相類似。此外,研究人員關(guān)注到腫瘤浸潤抗體分泌細(xì)胞的免疫球蛋白類型傾向于IgG型,尤其是IgG1亞型。

除此以外,研究人員還鑒定出了兩群在泛癌種水平上廣泛存在、在腫瘤中富集且具有預(yù)后潛力的亞群:應(yīng)激反應(yīng)記憶B細(xì)胞(stress-response memory B cell)和腫瘤相關(guān)非典型B細(xì)胞(TAAB),它們分別與癌癥患者更短和更長的生存期相關(guān)。應(yīng)激反應(yīng)記憶B細(xì)胞高表達(dá)應(yīng)激反應(yīng)相關(guān)基因,與之前報道的腫瘤相關(guān)功能失調(diào)NK細(xì)胞(tumor-associated dysfunctional NK cell)和應(yīng)激反應(yīng)T細(xì)胞(stress-response T cell)相類似,這兩類細(xì)胞的應(yīng)激反應(yīng)特征被報道與病人的不良預(yù)后或免疫治療不響應(yīng)相關(guān)。在嘗試尋找與患者的不良預(yù)后相關(guān)的TIB亞群時,研究人員發(fā)現(xiàn)調(diào)節(jié)B細(xì)胞(regulatory B cell),或者說IL10+ B細(xì)胞,在單細(xì)胞聚類分析中并不能單獨(dú)成群,這些細(xì)胞很可能源自B細(xì)胞分化的不同階段。

腫瘤富集的腫瘤相關(guān)非典型B細(xì)胞(TAAB)在腫瘤組織中具有高克隆擴(kuò)增水平和增殖能力,并呈現(xiàn)高度激活的轉(zhuǎn)錄狀態(tài)。CD4 T細(xì)胞,尤其是CXCL13+ CD4 T細(xì)胞,可能與腫瘤相關(guān)非典型B細(xì)胞(TAAB)在其激活和向漿細(xì)胞分化的過程中產(chǎn)生相互作用。重要的是,腫瘤相關(guān)非典型B細(xì)胞(TAAB)的特征與患者預(yù)后存在癌癥類型依賴性關(guān)聯(lián),并且也是多種免疫治療響應(yīng)的預(yù)測指標(biāo)。

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圖1. 泛癌種B細(xì)胞單細(xì)胞圖譜的摘要圖

綜上所述,該研究拓展了在泛癌種視角對腫瘤浸潤B細(xì)胞的了解,為B細(xì)胞的異質(zhì)性及其抗腫瘤免疫反應(yīng)提供了新的見解,并為未來進(jìn)一步探索B細(xì)胞在癌癥中功能的共性和多樣性奠定了基礎(chǔ)。

北京大學(xué)前沿交叉學(xué)科研究院CLS項(xiàng)目博士生楊雨、北京大學(xué)BIOPIC/生命科學(xué)學(xué)院博士生陳雪雁為該論文的并列第一作者,北京大學(xué)BIOPIC張澤民院士、深圳灣實(shí)驗(yàn)室陳敏敏副研究員、北京大學(xué)BIOPIC王東方副研究員為該論文的共同通訊作者。深圳灣實(shí)驗(yàn)室盤潔瑩、寧慧恒在本研究的免疫組化染色和細(xì)胞誘導(dǎo)等實(shí)驗(yàn)中提供了重要協(xié)助。



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